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中国社会科学院科学与无神论研究中心（以下简称研究中心）成立于2010年4月，是中国社会科学院院属的非实体研究中心。这是当代中国第一个“科学与无神论研究”的社会平台，定位目标为，不仅成为马克思主义无神论的学术研究中心，而且要成为应对宗教意识形态化、境外敌对势力利用宗教渗透的对策研究中心。研究中心成立后，与马克思主义研究院马克思主义无神论研究室、中国无神论学会和《科学与无神论》期刊四位一体，共同参与科学无神论学科的建设。
目前，研究中心由中国社科院马研院副院长龚云担任主任，中国社科院马研院中国化部副主任贺新元、中央社会主义学院马列部主任左鹏担任副主任。中心现有顾问5名：第十三届全国政协民宗委主任王伟光、第十二届全国政协民宗委主任朱维群、重庆市委常委、宣传部部长姜辉、中国藏学研究中心原党组书记朱晓明、中国社会科学院荣誉学部委员杜继文。还有教育部社科中心原主任田心铭研究员等学术指导委员会委员共十一名以及特聘研究员十三名。
研究中心下一步拟落实习近平总书记关于宗教工作和无神论相关论述的精神，通过半实体化等措施，整合现有的科学无神论研究和宣传教育资源，通过联络全国各高校的马克思主义学院、宗教学系、哲学系，组织编写教材，开展相关培训等。研究中心还将通过整合各种学术资源，推动中国的无神论研究走向国际无神论研究的学术前沿。